这一次,我问哈马达先生,他正在进行代谢组学的基础研究。
(访谈:广田凉子,福冈大学药学院助理教授)
菊池
谢谢你今天的时间。你能告诉我们你的研究吗?
哈马达先生
我们正在通过代谢组学进行培养细胞状态评估的基础研究。目前,我们正在研究细胞培养基中的氨基酸。
菊池
您的研究集中于何种目的?
哈马达先生
由于其低浓度,LC-MS / MS无法检测细胞中的一些低分子代谢物如氨基酸。
因此,浓缩样品以增加浓度,从而可以进行检测。
菊池
在集中注意力之前你做了什么工作?
哈马达先生
用有机溶剂和水的混合物提取培养细胞中的少量低分子量代谢物,然后使用万能溶剂闪蒸仪C10浓缩。
菊池
萃取后浓缩的有机溶剂有哪些类型?它们的容量是多少?
哈马达先生
约80%至80%甲醇溶液或乙腈溶液,每个800μL容量用聚丙烯1.5mL样品管干燥。
菊池
似乎含有水的样品是浓缩的,但温度设定是多少?
哈马达先生
由于我们希望尽快去除溶剂,我们将温度设置为50°C。根据我们的经验,我们认为样品中的游离氨基酸具有不受热影响的温度设定。
菊池
你能告诉我实际飞水/甲醇或水/乙腈时的样品数量和工作时间吗?
哈马达先生
首先,整个实验系统需要几天时间。
具体地,为了测量细胞内代谢物浓度随时间的变化,大约每24小时收集样品,提取需要30分钟,并且每天一次浓缩需要4至6个样品,持续2至3小时。它将是关于。该过程在几天内重复约5次。
菊池
是否需要缩短一项工作的时间,因为它需要几天的工作时间?
在引入便利店和蒸发之前的工作状况如何?
哈马达先生
马达先生
到目前为止,它是通过吹氮气干燥的。
我使用了与现在相同的容器,但我分别处理了1到2个样品,因此需要很长时间才能完成所有样品。因此,对于将“浓度”作为样品预处理操作存在阻力。
菊池
池
它是一种不能像现在一样使用氮气吹制方法同时处理4到6个样品的设备吗?
哈马达先生
生
号 氮气喷涂是铝块型装置,可以设置9个样品。
然而,由于氮气的流速增加并且消耗增加,所以在室温下在喷洒时留下数小时至半天,并且在一些情况下存在退化的风险,因此可以处理多达9个样品。即便如此,我还是在短时间内重复干燥一个或两个样本的过程。
菊池
菊池
我明白了 将处理方法分成一个或两个样品以降低样品变性的风险已成为一个耗时的因素。现在抵抗力已经消失了吗?
哈马达先生
达先生
是。即使含有水的样品也不需要花费太多时间来浓缩,而且不用担心氮气的消耗,你可以毫不犹豫地自由工作。
在特定时间收集样品并评估随时间的变化,但是使用常规方法,存在从提取到浓缩的过程中样品之间可能发生时间变化的担忧。 C10很有用,因为它可以同时处理4到6个样品。我觉得好的一点是同时收集的样品可以同时集中。
目前,浓缩样品可以通过LC-MS / MS测量,并且可以检测到约20种氨基酸。通过改变浓度方法,检测变得不可能或者未知峰在色谱图上显得很大。没有特别的事情。
菊池
即使是便利店/蒸发原理也不会影响LC-MS / MS测量,并且对预浓缩没有抵抗力。
菊池
如果你能够告诉我你第一次了解万能溶剂闪蒸仪时的感受,我将不胜感激。
哈马哈马达先生
达先生
起初,我在会议上了解了该机构和设备展的传单。
虽然有一个强烈的形象,即使含有水的溶液难以挥发,我觉得当我看到“可以跳过DMSO溶液”的声明时似乎非常有用。
最初只有一个样本模型,所以我想将它用于我自己的研究!我没有提出这个想法,但我是在实验室与其他教授协商后买的,因为出售了一个多样本模型。
菊池
池
我认为许多研究人员能够驾驶高沸点溶剂(如水和DMSO)很有吸引力。感谢今天的珍贵故事。谢谢你的未来。
哈马达先
采访者的评论
当通过LC-MS / MS检测氨基酸作为靶标时需要增加浓度的Hamada先生是为了避免浓缩过程中样品的变性以评估样品随时间的变化。 。以前,如果要处理的样品数量是4到6个样品,则必须将其分成1或2个样品并重复几次,因此需要花费太多时间,因此存在耐浓缩性。响应于这些问题,万能溶剂闪蒸仪C10可用于在同一条件下同时浓缩同时收集的样品。我能够阻止它。
此外,即使浓度方法发生变化,也存在LC-MS / MS测量中无法检测到的物质,未出现未知峰。
(采访者:菊池)